تعد كلية العلوم الطبية التطبيقية من ضمن إحدى الكليات الطبية بعرعر والتي تم إنشاؤها عقب صدور الأمر السامي بإنشاء جامعة الحدود الشمالية في العام 1428هـ، حيث تأسست الكلية بالأمر السامي رقم 10093/م في تاريخ 1428/11/21هـ وقرار مجلس وزارة التعليم ، الجلسة 46 في تاريخ 1428/6/2هـ بشطري الطلاب والطالبات بمدينة عرعر.
تسعى كلية العلوم الطبية التطبيقية لتكون ضمن أفضل كليات العلوم الطبية التطبيقية بالمملكة في تأهيل وتدريب خريجين من ذوي المعرفة والمهارات لتمكينهم من أداء الخدمات السريرية وكذلك إجراء البحوث العلمية على أعلي مستوى لخدمة المجتمع والارتقاء بالخدمات الصحية في منطقة الحدود الشمالية. يقوم على خدمة هذه الأهداف هيكل إداري وكادر أكاديمي متميز بالإضافة إلى اللجان والوحدات المختلفة لخدمة الطالب والمجتمع.
تقدم الكلية عدد من البرامج الأكاديمية في مرحلة البكالوريوس في كل قسم من أقسامها بشطري الطلاب والطالبات بمدينة عرعر. 
 تستغرق مدة الدراسة في الكلية أربع سنوات يدرسها الطالب بالكلية، وطبيعة الدراسة نظرية وتطبيقية (عملي وممارسات سريريه)، يمضي الطالب بعدها سنة إجبارية كاملة من التدريب الإكلينيكي (فترة الامتياز) في الأقسام الطبية بالمستشفيات المتقدمة في المنطقة ومختلف أنحاء المملكة، حيث يطبق ما تعلمه أثناء دراسته ويستفيد من خبرة من سبقوه على رأس العمل.  
تقوم الكلية بتخريج أخصائيين يعملون بوزارة الصحة، أو المستشفيات الحكومية التابعة للجامعات السعودية والمستشفيات العسكرية والمستشفيات والمراكز الخاصة في تخصصات تقنية المختبرات الطبية والتغذية الإكلينيكية. كما يستطيع خريج الكلية العمل في مراكز الأبحاث والجهات المعنية بالمواصفات والمقاييس مثل هيئة الدواء والأغذية.